Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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H2-Q1O19441 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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H2-Q1O19441 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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H2-Q1O19441 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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H2-Q1O19441 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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H2-Q1O19441 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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H2-Q1O19441 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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H2-Q1O19441 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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H2-Q1O19441 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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H2-Q1O19441 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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H2-Q1O19441 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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H2-Q1O19441 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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H2-Q1O19441 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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H2-Q1O19441 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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