Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casq1O09165 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Casq1O09165 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casq1O09165 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casq1O09165 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casq1O09165 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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