Protein–RNA interactions for Protein: L7N471

Gm7980, Predicted gene 7980 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7980L7N471 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms