Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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BC117090L7N257 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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BC117090L7N257 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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BC117090L7N257 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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BC117090L7N257 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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BC117090L7N257 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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BC117090L7N257 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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BC117090L7N257 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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BC117090L7N257 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC117090L7N257 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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BC117090L7N257 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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