Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5458L7N219 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5458L7N219 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm5458L7N219 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm5458L7N219 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm5458L7N219 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm5458L7N219 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm5458L7N219 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm5458L7N219 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5458L7N219 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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