Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Gm379J3QQ19 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Gm379J3QQ19 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Gm379J3QQ19 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
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Gm379J3QQ19 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Gm379J3QQ19 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Gm379J3QQ19 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Gm379J3QQ19 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Gm379J3QQ19 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Gm379J3QQ19 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Gm379J3QQ19 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Gm379J3QQ19 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Gm379J3QQ19 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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