Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3685J3QPP2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3685J3QPP2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms