Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim18J3QNP2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms