Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms