Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20873J3QMQ9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20873J3QMQ9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20873J3QMQ9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20873J3QMQ9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20873J3QMQ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20873J3QMQ9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Gm20873J3QMQ9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20873J3QMQ9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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Gm20873J3QMQ9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Gm20873J3QMQ9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gm20873J3QMQ9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gm20873J3QMQ9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Gm20873J3QMQ9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Gm20873J3QMQ9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Gm20873J3QMQ9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Gm20873J3QMQ9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Gm20873J3QMQ9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20873J3QMQ9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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