Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3727J3QM54 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms