Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Gm6176J3QK59 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Gm6176J3QK59 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Gm6176J3QK59 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6176J3QK59 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Gm6176J3QK59 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm6176J3QK59 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm6176J3QK59 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm6176J3QK59 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm6176J3QK59 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6176J3QK59 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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