Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms