Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms