Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp17lcG5E8I7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms