Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r34G3XA52 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms