Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20517G3UVU6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms