Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp32F8VPZ3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms