Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc37F8VPK0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ttc37F8VPK0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms