Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm5798F7BTS7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm5798F7BTS7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm5798F7BTS7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm5798F7BTS7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm5798F7BTS7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm5798F7BTS7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5798F7BTS7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm5798F7BTS7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm5798F7BTS7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm5798F7BTS7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Gm5798F7BTS7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Gm5798F7BTS7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm5798F7BTS7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm5798F7BTS7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm5798F7BTS7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5798F7BTS7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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