Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms