Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5861F6VCN9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5861F6VCN9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5861F6VCN9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5861F6VCN9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5861F6VCN9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5861F6VCN9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5861F6VCN9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5861F6VCN9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5861F6VCN9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5861F6VCN9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5861F6VCN9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5861F6VCN9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5861F6VCN9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5861F6VCN9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms