Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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