Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmod3E9QA62 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms