Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gm5407E9Q7Q1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gm5407E9Q7Q1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm5407E9Q7Q1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm5407E9Q7Q1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm5407E9Q7Q1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm5407E9Q7Q1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5407E9Q7Q1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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