Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms