Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FancfE9Q5Z5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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