Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms