Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms