Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms