Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms