Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD3

Dchs1, Protocadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 3,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dchs1E9PVD3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dchs1E9PVD3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dchs1E9PVD3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms