Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms