Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FgaE9PV24 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms