Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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BC035044E0CXF8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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BC035044E0CXF8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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BC035044E0CXF8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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BC035044E0CXF8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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BC035044E0CXF8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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BC035044E0CXF8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
BC035044E0CXF8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BC035044E0CXF8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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