Protein–RNA interactions for Protein: D4PHA7

Wscd2, WSC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wscd2D4PHA7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wscd2D4PHA7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wscd2D4PHA7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms