Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms