Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc8D3YZV8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms