Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc170D3YXL0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms