Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.9 ms