Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kpna7C0LLJ0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna7C0LLJ0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms