Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11bB4XVQ1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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