Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cyp26c1B2RXA7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms