Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfc3h1B2RT41 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfc3h1B2RT41 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfc3h1B2RT41 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfc3h1B2RT41 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfc3h1B2RT41 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfc3h1B2RT41 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms