Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrn3B2RS91 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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