Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H60cB1B213 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H60cB1B213 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H60cB1B213 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms