Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms