Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpruB1AUH1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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