Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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