Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint4A7TZF3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skint4A7TZF3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms